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Dumoncel Jean

Jean Dumoncel
Engineer in image processing
Tél. +33(0)5.61.55.80.78 – email : jean.dumoncel@univ-tlse3.fr

Position
CNRS engineer / Ph.D student in computer science

Current research
My research program focuses on reliable, reproducible and accurate comparison of human morphology in virtual anthropology. This comparison is necessary to understand evolutionary mechanisms, especially with regard to the evolution of man. In this context, I develop mathematical and computational tools for comparing three-dimensional shapes in order to study the intra and inter species variability. In this context, I am currently working on a thesis in computer science under the supervision of Jean-Pierre Jessel (Toulouse Institute of Computer Science Research - UMR 5005) and Gérard Subsol (Montpellier Laboratory of Informatics, Robotics, and Microelectronics - UMR 5006). My topic relates to geometric analysis for registration of 3D objects applied to paleoanthropology. In particular, I work on a tool developed by Stanley Durrleman (INRIA research scientist, Brain and Spine Institute) in collaboration with José Braga. This new method allows among other things to study the variability of longitudinal data or to build topological Atlas from shapes data.

Research experiences and collaborations
I also develop methods and tools applied to virtual anthropology. These methods are for instance :
- Generation of a geological model in order to study the evolution of a site. This work is part of a program of an archaeological mission directed by José Braga in a world heritage site of UNESCO. We use methods of 3D acquisition by laser scanning in collaboration with the IRIT and LIRMM laboratories and the IMA Solutions (http://www.ima-solutions.fr) and iqlaser (http://www.iqlaser.co.za) companies.
- Morphological analysis of three-dimensional images of the cochlea. I participated in a study of geometric morphometrics of the cochlea in different species directed by José Braga. This study includes a statistical study from morphological indexes. Developments have been made with MATLAB.
- Analysis of dental sequences : dental development and age estimation using a probabilistic approach (Braga et al., 2005, Non-adult dental age assessment : Correspondence analysis and linear regression versus Bayesian predictions, International Journal of Legal Medicine, 119, 260-274). A program under SCILAB has been developed.

Bibliography
-  ResearchGate : https://www.researchgate.net/profile/Jean_Dumoncel

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[FR] :
Position
Responsable du développement et du déploiement d’applications en imagerie 3D
Contact : jean.dumoncel@univ-tlse3.fr

Status
Ingénieur d’études CNRS / Doctorant en informatique

Programmes de recherche
Mon programme de recherche porte sur la comparaison fiable, reproductible et précise de la morphologie humaine. Cette comparaison représente l’une des clefs de compréhension des mécanismes évolutifs, en particulier en ce qui concerne l’évolution de l’Homme. Je cherche à développer des outils mathématiques et informatiques de comparaison de formes tridimensionnelles afin d’étudier les variabilités inter et intra-espèces. Dans ce contexte, je réalise actuellement ma thèse en informatique sous les directions de Jean-Pierre Jessel (Institut de Recherche en Informatique de Toulouse - UMR 5005), et de Gérard Subsol (Laboratoire d’Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier - UMR 5006). Le sujet porte sur l’analyse géométrique et morphométrique pour la caractérisation et le recalage des objets 3D utilisés en paléoanthropologie. Je travaille notamment sur un outil développé par Stanley Durrleman (chercheur INRIA, Institut du Cerveau et de la Moelle épinière) en collaboration avec José Braga. Cette nouvelle méthode permet entre autres d’étudier la variabilité sur des données longitudinales ou de construire des Atlas topologiques sur des échantillons de formes.

Expériences de recherche et collaborations
Je développe des méthodes et des outils appliqués à l’anthropologie virtuelle. Ces méthodes concernent par exemple :
- la génération d’un modèle numérique en vu d’étudier l’évolution d’un site de fouille. Ce travail s’inscrit dans le programme d’une mission archéologique dirigé par José Braga portant sur un site inscrit au patrimoine mondial de l’UNESCO. Pour cela, nous utilisons des méthodes d’acquisition 3D par scan laser en collaboration avec les laboratoires IRIT, LIRMM ainsi que les sociétés IMA Solutions (http://www.ima-solutions.fr) et iqlaser (http://www.iqlaser.co.za).
- l’analyse morphologique d’images tridimensionnelles de la cochlée. J’ai participé à une étude de morphométrie de la cochlée chez différentes espèces, dirigée par José Braga. Cette étude porte notamment sur une étude statistique à partir de critères morphologiques.
- l’analyse de séquences dentaires : estimation de l’âge et de développement dentaire en utilisant une approche probabiliste (Braga et al., 2005, Non-adult dental age assessment : Correspondence analysis and linear regression versus Bayesian predictions, International Journal of Legal Medicine, 119, 260-274).