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Paléogénomique des populations anciennes humaines et microbiennes

par catherine Theves - publié le , mis à jour le

Paléogénomique des populations anciennes humaines et microbiennes
Responsable : Catherine Thèves

La comparaison des données culturelles (telles qu’elles ressortent du contexte archéologique et des sources historiques), les génomes et les paléogénomes offrent une occasion fantastique pour étudier les processus de co-évolution entre l’Homme et leur environnement. Cela est particulièrement vrai dans le cas des maladies infectieuses où l’émergence et la propagation de nouveaux agents pathogènes fournit de nouvelles pressions sélectives pour les populations infectées, et où l’émergence d’allèles de résistance liées à l’immunité peut en retour modifier la trajectoire évolutive de l’agent pathogène, conduisant à la sélection des de nouvelles formes virulentes. Cela est également vrai pour toute une gamme d’autres processus qui sont cruciales dans l’évolution humaine récente et ont façonné l’histoire de la civilisation humaine. L’un de ces processus est représenté par la domestication, qui a transformé les animaux sauvages vers une diversité d’animaux domestiqués modernes, qui englobe toute une série d’adaptations phénotypiques, mais qui a également menée à une grande variété de différenciation culturelle entre les groupes humains. Cet axe est de recherche est mené par le professeur L. Orlando, chaire universitaire IDEX, en utilisant la domestication du cheval comme modèle. Plusieurs sites de terrain et des périodes de temps sont ciblés dans nos travaux, dont la majorité sont fouillés et étudié par le laboratoire AMIS, en France et à l’étranger, et couvrent le bassin méditerranéen, la Mongolie et la frange de l’océan Arctique.

Fouille République Sakha
copyright AMIS

* Thèmes de recherche :
- Évolution humaine, Variabilité, histoire démographique et micro-évolution
- Relations familiales au sein et entre les sites archéologiques, histoire des populations, origines géographiques
- Santé et état bucco-dentaire des populations du passé, évolution des pathogènes et des maladies
- Chevaux : évolution et adaptation, histoire évolutive
- Paleoprotéomique

* Recherches en cours :
- Paléogenetique et paléogénomique des populations yakoutes du 16e au 19e siècle, Sibérie Orientale
- Adaptation au froid des chevaux yakoutes, Sibérie
- Paléogénétique des populations de l’Altai et de de Mongolie
- Etude des relations de parenté dans les sépultures collectives du néolithique, Europe
- Recherche sur les pathogènes dans les populations françaises du Moyen Age au 18e siècle
- Développement d’approches protéomiques des maladies et identification de biomarqueurs de l’alimentation dans les populations du passé