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Soutenance de these de F. Delehelle

publié le

Soutenance de thèse par Franklin Delehelle (équipes REVA/APO IRIT/ et UMR 5288 AMIS)
"ASGART - Cartographie de novo des duplications segmentaires à l’échelle génomique"

Soutenance prévue le jeudi 06 juin 2019 à 10h30
Lieu : 37 Allée Jules Guesde, 31000, Toulouse
Salle du Conseil

Mots-clefs : duplication,génome,données massives,humains,primates,biologie évolutive

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Jury

Mme Macha NIKOLSKI Université de Bordeaux Rapporteur
M. Dominique LAVENIER IRISA/INRIA Rapporteur
Mme Séverine BéRARD Université de Montpellier Examinateur
Mme Émilie LECOMPTE Université Toulouse 3 Paul Sabatier Examinateur
M. Hervé LUGA Toulouse 2 - Jean Jaurès Directeur de thèse
Mme Patricia BALARESQUE Université Toulouse 3 Paul Sabatier Co-directeur de thèse

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Résumé :
Le séquençage de nombreux génomes ces dernières décennies a mis en exergue une large proportion de séquences dupliquées dans l’immense majorité d’entre eux, à diverses échelles. Parmi ces duplications, les SD (duplications segmentaires) sont d’un intérêt particulier de par l’influence qu’elles exercent dans les mécanismes de création de variation génétique. Ces zones, historiquement ardues à séquencer, commencent à voir leur accès se démocratiser grâce à l’amélioration ou au développement des techniques idoines. Pour faciliter l’exploitation in silico de ces nouveaux flux de données numériques, nous avons développé ASGART, un programme efficace, rapide, dédié à la détection précise des zones dupliquées dans des fragments d’ADN. Nous présentons ensuite quelques résultats préliminaires obtenus grâce à ASGART, en particulier dans le domaine de l’évolution des chromosomes sexuels.